Uma das principais características do programa de Mestrado em Economia é a grande oferta de disciplinas optativas. Por ano, são ofertadas mais de 30 disciplinas. Entre as sete disciplinas optativas que deverá cursar, o estudante poderá optar por qualquer combinação de disciplinas das cinco áreas de interesse, de forma a melhor atender aos objetivos de sua pesquisa e seus interesses profissionais. Estimula-se, fortemente, que o estudante curse disciplinas de diferentes áreas de interesse, com vistas a ressaltar o caráter interdisciplinar da formação do mestrando.